Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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