Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SPIDRQ14159 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SPIDRQ14159 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SPIDRQ14159 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPIDRQ14159 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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