Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SCARB2Q14108 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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