Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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