Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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