Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms