Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms