Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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