Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
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