Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GRIK3Q13003 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GRIK3Q13003 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GRIK3Q13003 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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GRIK3Q13003 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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