Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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