Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
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