Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms