Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms