Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms