Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC3A1Q07837 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms