Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms