Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms