Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBXN1Q04323 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms