Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms