Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms