Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms