Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APBA1Q02410 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms