Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX1P78337 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms