Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms