Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKP1P63208 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKP1P63208 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKP1P63208 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKP1P63208 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKP1P63208 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKP1P63208 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP1P63208 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms