Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms