Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms