Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX10P56693 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX10P56693 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX10P56693 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX10P56693 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX10P56693 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX10P56693 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX10P56693 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX10P56693 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX10P56693 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX10P56693 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX10P56693 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms