Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTTPP55157 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTTPP55157 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms