Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB1P54762 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB1P54762 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB1P54762 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB1P54762 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB1P54762 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB1P54762 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms