Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFIP1P53367 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms