Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF143P52747 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms