Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERFP50548 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERFP50548 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERFP50548 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERFP50548 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms