Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms