Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms