Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms