Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTX2P32243 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTX2P32243 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms