Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms