Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHC1P29353 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHC1P29353 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms