Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2E2P29084 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms