Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms