Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTSSP25774 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTSSP25774 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTSSP25774 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSSP25774 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTSSP25774 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTSSP25774 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTSSP25774 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTSSP25774 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTSSP25774 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTSSP25774 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms