Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERBB3P21860 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERBB3P21860 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms