Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT1P21579 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms