Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms