Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DESP17661 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DESP17661 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DESP17661 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DESP17661 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms