Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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