Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms