Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLUP10909 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUP10909 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms